事业单位是我国在传统政治体制下形成的一种特殊组织形式，它“半官半民”的属性，以及与政府、企业之间错综复杂的关系，导致了其在组织及部门归属上的定位困难。而从组织功能的角度考察，我国以社会公益服务为目的的教育、科技、文化和卫生等社会服务组织，在很大程度上与国外的“非营利组织”基本一致。然而，由于历史原因，介于政府和企业之间，事业单位存在着自身的组织定位悖论，这种悖论直接妨害了事业单位的组织运行逻辑。随着市场经济的发展，“让市场发挥决定性作用”成为未来社会改革的主导思想，传统体制下事业单位的组织管理模式，已经越来越不能够适应提升公共服务质量与效率的要求。
事业单位组织管理现状
具体来说，事业单位的组织管理现状存在以下特点：
1、管理模式行政化
事业单位数量多，涉及内容广泛。根据国家发展和改革委员会数据，我国有事业单位130万个，其中独立核算事业单位95.2万个，纳入政府事业单位编制的人员近3000万人。事业单位与企业和政府部门相比，主要优势在于其提供公共服务的专业化水平，但目前事业单位的管理模式行政化倾向较为明显，按照行政级别和行政层级进行管理和控制，存在着从部级、司级到县级和科级等不同层级的事业单位。
设立事业单位的规范有政府制定，宏观性、政治性、行政性较强，反映社会公共管理规模的特征较弱。在特定的政治经济体制和意识形态下，强调与之想适应的“事业”性质，社会事业与经济活动，行政行为与公益行为、行政行为与企业行为，事业行为与企业行为的边界不清。事业单位的社会定位、管理和运行长期缺乏法律规范，加上条块分割、各级政府的理解、运作和利益趋向的异同，以及人事整合所造成的认为因素等，是的事业单位的设立存在非规定性与随意性，导致事业单位不规则膨胀，人浮于事，同时，政事、政企、事企不分，矛盾交织。在计划经济条件下，所有制形式单一，高度国有化，事业单位由各级政府主办和管理，根据指令性计划要求运行，成为政府的附属。事业单位内部层层下达指令计划，自身没有租住权，失去主动性。
2、职能目标计划化
计划化是传统事业单位的一个重要特征，是与整个计划经济体制相适应的。各级政府按照各自的发展规划和计划，以指令性计划的形式安排各事业单位，这种高度集中使事业单位丧失了自主决策权，隔断了事业单位的市场联系，使事业单位成为完成上级下达的事业计划的一种工具，成为上级行政主管部分的附属物，更进一步强化了事业单位的行政化。与之相反，从事市场化生产经营活动的事业单位，其组织管理方面已经在向市场上的同类活相似企业看齐或靠拢。
3、资源配置指令化
国家包办一切事业，是通过政府各事业职业部门及其附属的各类事业单位来实现的。而国家的各类事业资源，也是通过各种行政化方式来加以配置和运用的。由于事业单位行为方式的非产业化，以及国家财政无偿供给各类事业经费，人员调配和工资额度完全按计划执行，造成资源配置严重不合理。同时，这种体制和机制又直接推动各部门、各地区、各单位为了各自利益，简历各自所属的事业体系或争取更多的事业资源，包括要经费、要编制、要项目，形成了“政出多门”、“事出多门”的事业发展格局，造成了“大而全”、“小而全”的分割与封闭型的事业发展模式。
4、行为模式双面化
所有事业单位在设立时都将为社会提供服务和不以盈利为目的作为条件，具有非政非企性质。兼具行政管理和市场经营活动的单位，一般采取“双体系并行管理”的原则，即市场化的经营活动与行政管理职能分别设置部门进行管理，但一些单位在伺候的运作过程中，在为经合法授权和主客观条件具备的前提下，逐步演变成“亦事亦政亦企”，即依事业之名，拥有并从事行政管理活动，或形成企业经营行为，从而一方面享受财政供养，另一方面实施行政收费或盈利性经营。
总体来看，当前我国事业单位的组织管理方式与公共服务需求时间的矛盾日益突出，事业单位面临着迫切的、系统性的组织变革要求。
事业单位组织管理的问题和弊端
从组织视角考察，困于传统体制的局限，在组织设计和制度安排方面，我国的事业单位存在着一系列问题和弊端，主要变现为以下四个方面：
1、边界的模糊性
组织必须维持其余环境之间的边界才能生存，如果没有可辩的边界，则不存在组织。明晰的组织边界是进行组织结构设计、组织资源安排和组织功能配置的必然结果，也是组织保持自主性和独立性，有效几区外部资源和支持，满足社会功能需求的重要前提。
2、体制的依附性
组织体制是组织内部各个层级之间、各个部门之间的不同权利配置关系的总和，其形式包括权利集中体制和权利民主体制、控制型体制和管理型体制。在传统计划经济体制下，国家包办、政府统管，政治权利的渗透和控制造成政府与事业单位组织边界的交叉，由此形成了事业单位对政府行政控制的依附格局。
3、管理结构形式的单一化
组织的管理结构形式是组织为实现具体目标而形成的对权利、职责的具体安排，包括组织部门结构、组织层次结构及其相互沟通、控制和协调的组织制度等，它是决定组织效率的关键因素。事业单位的性质、目标、功能、活动内容与运作方式等均不同于政府机构、企业，所以事业单位的组织管理机构形式也有别于其它组织。
4、环境约束的软化
事业单位的产品和服务直接面向社会，关系到个人和群体的利益得失，因而社会的监督和约束构成了事业单位存在与发展的重要外在环境。但是事业单位对政府的行政依附体制，使得组织的生存资源直接来自于政府的支付，从而隔断了事业单位第社会的公共责任关系。
历史和体制的原因使得我国事业单位的社会监督较为薄弱，主要表现在：第一，公众监督意识薄弱，社会主义制度下对利益高度一致性的国度强调，政治领域对权力缺乏制衡和制度化约束等，造成公民权利意识和监督意识淡薄；第二，新闻舆论监督的无力，主要体现在舆论监督渠道不畅、新闻媒介的监督力度不足、舆论监督滞后于其它监督等；第三，民间监督和评估组织的缺失，发达国家的民间监督和评估机构发挥着对工艺机构的绩效进行评价和监督的作用，而我国在这方面的缺失是显而易见的。
